近期，完美生科院自主研發(fā)的二代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析軟件“TransAnalyzer”成功獲得國(guó)家軟件著作權(quán)證書。

　　這是繼前兩款軟件 (點(diǎn)擊查看) 之后，生科院獲得的第三個(gè)自主研發(fā)軟件的軟著證書，標(biāo)志著生科院在生物信息學(xué)分析領(lǐng)域取得了新的突破，為后續(xù)科研和產(chǎn)品開發(fā)提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支持。

　　軟著證書

　　轉(zhuǎn)錄組(Transcriptome)廣義上指細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合，包括信使RNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及非編碼RNA等。作為基因表達(dá)的中間產(chǎn)物，轉(zhuǎn)錄組不僅搭建了基因組與蛋白質(zhì)組之間的橋梁，更是生命活動(dòng)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中不可或缺的一環(huán)。

　　轉(zhuǎn)錄組學(xué)關(guān)注的是基因轉(zhuǎn)錄成RNA的過程以及轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控機(jī)制，即基因表達(dá)的“第一步”及其后續(xù)調(diào)控。通過轉(zhuǎn)錄組，完美可以揭示基因表達(dá)調(diào)控的整體特征，發(fā)現(xiàn)生物學(xué)過程相關(guān)的分子作用機(jī)理，以及查找具有特殊功能的基因。

　　轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq)技術(shù)的出現(xiàn)，為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究帶來了革命性的突破。這一基于高通量測(cè)序的方法，能夠系統(tǒng)地解析細(xì)胞或組織中的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物，全面揭示基因轉(zhuǎn)錄水平的微妙變化，并繪制出復(fù)雜的生物學(xué)通路與性狀調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的精細(xì)圖譜。

　　轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)[1]

　　近日，瑞典卡羅琳醫(yī)學(xué)院宣布了一項(xiàng)令人矚目的決定：將2024年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)的殊榮授予維克托·安布羅斯 (Victor Ambros) 教授與加里·魯夫昆 (Gary Ruvkun) 教授，以表彰他們?cè)趍icroRNA (miRNA) 領(lǐng)域的開創(chuàng)性發(fā)現(xiàn)及其對(duì)轉(zhuǎn)錄后基因調(diào)控機(jī)制的深刻洞察。

　　miRNA作為轉(zhuǎn)錄組中的一類非編碼RNA，通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的精確捕獲及轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析，得以在細(xì)胞的微觀層面展現(xiàn)其調(diào)控基因的神奇作用，為非編碼區(qū)域的功能研究開辟了全新的視野。

　　來源：諾貝爾獎(jiǎng)官方

　　轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的精髓在于其能夠敏銳地捕捉到轉(zhuǎn)錄組隨著環(huán)境條件、生物體發(fā)育階段以及不同組織與細(xì)胞間的差異所展現(xiàn)出的動(dòng)態(tài)變化。

　　無論是成熟線蟲與幼蟲之間的差異，還是藥物干預(yù)前后細(xì)胞狀態(tài)的顯著轉(zhuǎn)變，轉(zhuǎn)錄組都以其獨(dú)特的方式記錄并反映這些變化。通過分析在特定時(shí)間與特定條件下細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄本的差異表達(dá)信息，轉(zhuǎn)錄組學(xué)得以全面揭示基因表達(dá)調(diào)控的整體特征，深入剖析了基因表達(dá)水平的動(dòng)態(tài)波動(dòng)以及基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜性與靈活性。

　　因此，轉(zhuǎn)錄組學(xué)不僅是理解生命現(xiàn)象的重要工具，更是探索基因功能、解析生物體適應(yīng)機(jī)制及疾病發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵途徑。

　　在保健食品與化妝品研發(fā)領(lǐng)域，轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)成為革新動(dòng)力，為產(chǎn)品開拓了新的研發(fā)路徑與可能性。

　　健康食品領(lǐng)域

　　轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)可以深入探索生物活性化合物與實(shí)現(xiàn)膳食營(yíng)養(yǎng)功能相關(guān)的基因，揭示食品中生物活性化合物對(duì)人體健康的潛在效益，從而推動(dòng)新型保健食品的創(chuàng)新與開發(fā)。

　　例如，完美運(yùn)用轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)技術(shù)成功揭示了“桑葉沙棘蛋白肽”促進(jìn)大鼠體重減輕以及改善非酒精性脂肪肝的機(jī)制。

　　化妝品領(lǐng)域

　　借助轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)，完美可以對(duì)化妝品原料的功效及其相關(guān)分子機(jī)制進(jìn)行全面分析，深度挖掘原料的潛在功效，為化妝品新產(chǎn)品的開發(fā)提供堅(jiān)實(shí)的科學(xué)理論依據(jù)。

　　產(chǎn)品安全性評(píng)估

　　保健食品和化妝品中的活性成分可影響細(xì)胞基因表達(dá)調(diào)控。

　　轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析能夠剖析這些成分的作用機(jī)制，篩選有效成分，并進(jìn)行安全性評(píng)估，確保產(chǎn)品在實(shí)際應(yīng)用中的安全可靠性。

　　為了更高效、準(zhǔn)確地解讀和分析轉(zhuǎn)錄組測(cè)序產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù)，生科院生物信息學(xué)團(tuán)隊(duì)開發(fā)了分析軟件“TransAnalyzer”，具備以下特點(diǎn)和性能：

　　√ 先進(jìn)算法與最新數(shù)據(jù)庫：

　　軟件結(jié)合了穩(wěn)定先進(jìn)的算法和最新數(shù)據(jù)庫，為研究人員提供了強(qiáng)大的數(shù)據(jù)分析支持。

　　√ 全流程集成：

　　能夠完成原始下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制、轉(zhuǎn)錄本比對(duì)、差異基因注釋以及基因功能注釋等全面分析。

　　√ 準(zhǔn)確性和可靠性：

　　通過與多家第三方實(shí)驗(yàn)室比對(duì)，軟件的準(zhǔn)確性和可靠性得到了充分證明。

　　√高效批量處理：

　　軟件已部署于完美生物信息學(xué)專用高性能服務(wù)器集群上，可實(shí)現(xiàn)成百上千個(gè)原始數(shù)據(jù)的批量分析，極大地提高了分析效率。

　　此次“TransAnalyzer”軟件的成功研發(fā)并獲得軟著證書，是完美生科院在生物信息學(xué)領(lǐng)域取得的又一重要成果。

　　該軟件將為保健食品和化妝品的研發(fā)提供更為科學(xué)、準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)支持，助力提升產(chǎn)品效能。未來，生科院將繼續(xù)秉承創(chuàng)新精神，不斷深化轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的研究與應(yīng)用，為科學(xué)研究賦能產(chǎn)品打下更堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

　　相信在不久的將來，更多具有創(chuàng)新性和實(shí)用性的科研成果將從生科院誕生，為人類健康和美麗事業(yè)貢獻(xiàn)更多力量。

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